办公厅是国家税务总局主管日常公事、文秘和局机关行政处理事务的归纳职能部分。主要职责是：担任机关文电、机要、会务、档案、信访、保密和捍卫等作业；承当税收宣扬、政务揭露和新闻发布作业；处理机关财政和其他行政事务。
方针法规司是国家税务总局主管税收方针和税收法制作业的归纳职能部分。主要职责是：起草税收法律法规草案、部分规章及标准性文件；研讨提出税制变革主张；拟定税收事务的规章准则；研讨、承办触及世贸安排有关税收事项；承办严重税收案子的审理和行政处罚作业；承当机关有关标准性文件的合法性审阅作业；承办税务行政复议、行政应讼作业。
货品和劳务税司是国家税务总局主管增值税、消费税、营业税、车辆购置税（以下简称货品和劳务税）、进出口税收和文化事业建造费方针和征收处理的职能部分。主要职责是：安排施行增值税、消费税、营业税、车辆购置税等（不含海关代征的）征收处理作业，拟定详细征收处理方针和方法；对有关法律法规在履行中的一般性问题进行解说和处理；安排施行出口退税处理作业。
所得税司是国家税务总局主管企业所得税、个人所得税（以下简称所得税）和法律法规规则的基金（费）方针和征收处理的职能部分。主要职责是：安排施行企业所得税、个人所得税和法律法规规则的基金（费）等征收处理作业，拟定详细征收处理方针和方法；对有关法律法规在履行中的一般性问题进行解说和处理。
产业和行为税司是国家税务总局主管产业和行为各税方针、教导和监督产业和行为各税征收处理作业的职能部分。主要职责是：安排施行房产税、城市房地产税、乡镇土地使用税、城市保护建造税、印花税、资源税、土地增值税、固定资产出资方向调节税、车船税、烟叶税、契税、犁地占用税等（以下简称产业和行为各税）及教育费附加的税收事务处理，拟定详细征收处理方针和方法；对有关法律法规在履行中的一般性问题进行解说和处理；教导产业和行为各税种及教育费附加的征管事务。
世界税务司是国家税务总局主管世界税收、世界税务协作沟通和外事作业的职能部分。主要职责是：研讨拟定国家（区域）间反避税办法，安排施行反避税查询；参加国家（区域）间税收协议、协议商洽，承办草签和履行有关协议、协议等作业；承办与世界安排、国家（区域）间税务机关的协作与沟通事务；处理总局机关和税务系统外事作业。
社会保险费司（非税收入司）是国家税务总局主管税务系统社会保险费和有关非税收入征管作业的职能部分。主要职责是：担任根本养老保险费、赋闲保险费、工伤保险费、根本医疗保险费和生育保险费等社会保险费以及有关非税收入的征管职责划转、履行以及后续的征收处理各项作业；担任与相关部分的信息同享和作业和谐；参加相关方针的拟定和法律法规调整。
收入规划核算司是国家税务总局主管安排税收收入、税款交纳入库、税收剖析猜测、要点税源监控、税收管帐计算核算和税收数据处理使用作业的归纳职能部分。主要职责是：编制税收收入中长时间规划，编制年度税收使命、出口退税目标；参加起草税款征缴退库准则，监督查看税款缴、退库状况；承办税收收入的剖析、猜测和要点税源监控处理作业；拟定税收收入规划和税收管帐、计算等相关准则；处理税收数据；安排施行税收计算作业。
交税服务司是国家税务总局主管交税服务作业的归纳职能部分。主要职责是：安排施行交税服务系统建造；拟定交税服务作业标准和操作规程；安排和谐、施行交税教导、咨询服务、税收法律救助等作业，受理交税人投诉；安排施行税收信誉系统建造；教导税收争议的调停；起草注册税务师处理方针，并监督施行。
征管和科技展开司是国家税务总局主管税收征收处理和税收处理信息化建造的归纳职能部分。主要职责是：起草归纳性税收征管标准性文件；拟定税收征收处理的长时间规划和归纳性计划；处理税收发票和票证；拟定和安排施行税收处理信息化的总体规划和施行计划，承办税收处理信息化建造中事务需求整合和流程优化的归纳处理作业。
大企业税收处理司是国家税务总局主管大企业税收服务和处理的职能部分。主要职责是：承当大企业税收危险剖析、税收经济剖析和税源监控作业职责；教导税务系统大企业税收危险剖析应对作业；安排展开大企业个性化交税服务；教导海洋石油税收处理事务。
稽察局是国家税务总局主管税务稽察作业的职能部分。主要职责是：起草税务稽察法律法规草案、部分规章及标准性文件；处理严重税收案子的立案和查询的有关事项并提出处理意见；教导、和谐税务系统的稽察作业。
财政处理司是国家税务总局主管税务系统经费、配备、固定资产、根本建造的职能部分。主要职责是：拟定税务系统财政、基建处理方法；处理税务系统的经费、财政、配备、固定资产；审阅汇编税务系统的财政预决算；处理各项经费的领拨。
督察内审司是国家税务总局主管税收执法监督查看、内部财政审计和领导干部经济职责审计的职能部分。主要职责是：安排施行税收法律法规、部分规章及标准性文件履行状况的监督查看；承办税务系统财政、基建、大宗物品收购审计和领导干部经济职责审计作业。
人事司是国家税务总局主管人事、安排编制作业的职能部分。主要职责是：拟定税务系统人事准则并安排施行；处理税务系统的人事、安排编制作业；安排施行税务系统思想政治作业和精神文明建造。
党建作业局（党委宣扬部、巡视作业办公室）是国家税务总局主管税务系统党的建造、思想政治建造和巡视巡察等作业的职能部分。主要职责是：帮忙税务总局党委履行全面从严治党主体职责；催促税务系统各级党安排履行管党治党职责，宣扬和履行党的路线方针方针；统筹税务系统思想政治建造、意识形态建造、税务文化建造、精神文明建造和统战作业；安排税务总局党委巡视作业，教导和查看税务系统巡察作业。
机关党委是国家税务总局主管党群作业的职能部分。主要职责是：担任机关和在京直属单位的党群作业。
离退休干部局是国家税务总局主管离退休干部作业的职能部分。主要职责是：担任机关离退休干部作业，教导税务系统离退休干部作业。