企业跨县运营需求在迁出地处理国地税清税及缴销发票手续并在迁入地税务机关从头领用新发票。相关程序杂乱，耗时耗力，一起有一段企业无法开具发票的空白期，影响企业正常生产运营。
现在的规则是企业跨县运营就需求处理税务搬迁手续。依据税收征管法实施细则“交税人因居处、运营地址变化，触及改动税务挂号机关的，应当在向工商行政管理机关或许其他机关请求处理改动、刊出挂号前，或许居处、运营地址变化前，持有关证件和材料，向原税务挂号机关申报处理刊出税务挂号，并自刊出税务挂号之日起 30日内向迁达地税务机关申报处理税务挂号”的规则，在原主管税务机关处理搬迁刊出手续，并自刊出税务挂号之日起30日内向迁达地主管税务机关申报处理税务挂号。一起，在处理搬迁刊出手续时，企业应结清各项税款，因而国地税一般还都需求查账。
例如，北京某企业迁址----其所租借的写字楼由东城区改动为海淀区。因触及跨县运营就需求处理税务清算手续，还需求税务师事务所(往往是所属税务局指定)出具税务清税陈述，迁出区县的国地税税务局以为必要时还要让企业将最近三年的一切凭据送至税务局查看，其间还要缴销发票，时刻有时长达一个多月以上。因发票被缴销，在此期间内企业无法正常开具发票，这也为税务人员的权利寻租发明了条件。与此一起，这其间还触及各区县的利益即争抢税源。例如海淀区就规则年交税30万元以上企业一般不得迁出，其依据仅为区政府的办公会纪要。当然北京的做法较全国比较仍是相对人性化，例如北京市规则：企业在处理跨区县运营时，能够仅仅改动营业执照和税务挂号证上的运营地址，税务联系仍是保留在原迁出地的主管国地税局，但这样企业每月报税和购买发票就仍是需求去原税务机关，间隔和时刻都花费较多，也为北京市的交通堵塞做出了必定奉献。实际上，企业为了便利运营的考虑一般仍是期望迁入现运营地的主管税务机关。
在经济全球化的今日，商场时机少纵即逝。主张修正现行规则，由跨县运营改动为跨省运营才需求处理清税手续，即本省范围内改动运营地址时简化相关处理流程，答应企业自在迁转。一起主张改动税务局内部的属地化管理模式，以省级乃至全国的税务信息联网来处理体系内部的交流和协调问题，让企业把更多的时刻和精力放在生产运营中来，一起也削减其间的权利寻租空间。
1999年国家分税制变革后除上海外，税务体系一分为二，构成两套人马，但也发生的许多实际问题。例如企业每月报税或许领购发票要别离去两个税务局;税务查看企业需求招待两拨人马;税务体系被人为分裂后，国税的人不明白地税的税种，反之亦然，导致企业与税务机关交流交流困难。此外，企业的寻租的本钱也相应扩展。
现在，营改增后地税工作量显着缺乏，现在看到的状况多是国税很忙;地税工作较少，地税办税大厅有时空空荡荡。
2011年开端的营改增为国地税兼并创改造了条件。主张从国家层面仔细考虑该问题，整合资源，实在减轻企业担负，不要总是折腾企业，让企业把更多的时刻和精力放在生产运营中去。
为平衡各地利益，自2008年开端，依据国税发[2008]28号文和财预[2012]40号规则，关于跨省市总分组织，企业在按季度交纳所得税和年终汇算清缴时需求依据三项要素在总组织和分支组织别离交纳企业所得税，添加企业工作量，形成企业运营本钱的添加
2008年之前，关于跨省市总分组织只需求在总组织所在地交纳企业所得税，分支组织无需在分支组织所在地交纳。但往往总组织集中于大城市，分支组织集中于中小城市，形成各地税源不均。为平衡各地利益，自2008年开端，依据国税发[2008]28号文和财预[2012]40号规则，关于跨省市总分组织，企业在按季度交纳所得税和年终汇算清缴时需求依据三项要素在总组织和分支组织别离交纳企业所得税。三项要素的核算较为杂乱，企业无法做到一望而知，分配后还需求在企业的总分组织别离交纳，费时吃力，添加企业担负和本钱，一起也为各地的交通堵塞做出了必定奉献。
现在集团化企业方式越来越遍及，税务机关的管理模式也应相应改动，主张废止财预[2012]40号的规则，一致由企业在总组织所在地交纳企业所得税。税务机关能够全国联网，依据税务组织内部测算的必定份额自行在各地的总分组织之间分配税源，而不要把对立搬运给企业、折腾企业，让企业把更多的时刻和精力放在生产运营中来。